代辦食品許可證的流程如下：
1.申請：申請人向政務服務大廳窗口提出許可申請，提交申請材料。
2.受理：接件受理人員核驗申請材料，當場作出是否受理的決定。若能當場予以受理決定，應即時告知申請人；不能當場受理的，應在規定期限內做出是否準予許可決定。
3.審查：對已受理的行政審批事項進行審查，在規定期限內作出是否準予許可的決定。
4.領取結果：通過窗口領取辦理結果。