海淀區市場監管局可以通過以下方式加強現場核查指導：

1. 制定詳細的現場核查計劃和標準：根據食品經營許可證的審核標準和企業的具體情況，制定詳細的現場核查計劃和標準，明確每個環節的核查內容和標準，確保現場核查工作的有序進行。

2. 提供的現場指導和培訓：在現場核查過程中，對于不符合審核標準的地方，海淀區市場監管局應提供的指導和培訓，幫助企業改正問題并確保其符合審核標準。

3. 建立現場核查檔案：將現場核查的結果和指導建議記錄在案，建立完整的現場核查檔案，方便企業和監管部門隨時了解現場核查的情況和企業的整改情況。

4. 加強現場溝通和反饋：在現場核查過程中，應加強與企業的溝通和反饋，及時解答企業的疑問和困惑，確保企業能夠充分理解并整改存在的問題。

5. 定期開展現場核查培訓：針對現場核查中可能遇到的問題和困難，定期開展現場核查培訓，提高監管人員的核查能力和水平，同時也幫助企業更好地理解和掌握審核標準。

通過以上措施，海淀區市場監管局可以更好地履行現場核查指導職責，幫助企業更好地達到審核標準，提高食品經營許可證的辦理效率和企業的合規水平。