代辦北京通州排水排污許可證的具體流程可能因地區和政策的不同而有所差異。通常情況下，代辦公司會根據企業的具體情況和需求，提供個性化的服務流程和報價。以下是一般的代辦流程供參考：

1. 初步咨詢：首先，企業可以通過電話、在線咨詢或面談等方式，與代辦公司進行初步溝通。代辦公司會了解企業的基本情況、業務需求和辦理時間等。

2. 簽訂合同：在確認企業的需求和代辦公司的服務范圍后，雙方會簽訂正式的合同。合同中會明確雙方的權利和義務，以及代辦服務的具體內容、費用、辦理時間等細節。

3. 材料準備：代辦公司會根據企業的具體情況，協助企業準備申請排水排污許可證所需的材料。這包括但不限于企業資質證明、排污情況說明、排水管網圖等相關文件。

4. 提交申請：代辦公司會代表企業向當地相關部門提交申請，并協助企業完成申請表格的填寫和材料的提交。

5. 審核與評估：相關部門會對企業提交的材料進行審核和評估。這個過程中，代辦公司會積極配合相關部門的工作，提供必要的支持和協助。

6. 許可證領取：如果企業的申請被批準，代辦公司會協助企業領取許可證并進行相關手續的辦理。

請注意，以上流程僅供參考，實際辦理過程中可能會有所不同。建議企業在具體操作前，先咨詢當地的或相關機構，了解具體的辦理流程和要求。同時，選擇正規的代辦公司進行合作，以確保辦理過程的合法性和安全性。